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深圳市艾斯基因科技有限公司
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張老師

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簡化基因組甲基化測序 (RRBS)

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簡化基因組甲基化測序 (RRBS)通過酶切富集啟動子及CpG 島區域,并進行Bisulfite 測序
產品介紹

簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),

通過酶切富集啟動子及CpG 島區域,并進行Bisulfite 測序;

作為高性價比的甲基化研究方法,RRBS在大規模臨床樣本的研究中具有普遍的應用;

在經典RRBS基礎上,艾斯基因在國內較早推出強化版 RRBS,助力全基因組甲基化測序,

可覆蓋全基因組范圍內超過6-9M個CpG 位點,>90%數量的CpG島及>85%數量的基因啟動子。

重點技術質控,用心服務每一個項目

艾斯團隊專注表觀組學10年,提供專業有價值的DNA甲基化完整解決方案;

較早開發RRBS技術團隊之一, 國內較早推出強化版RRBS服務;

已經完成人、哺乳動物及魚類等多個物種, 10000+例樣本項目經驗;

嚴格的RRBS技術質控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite轉化率>99%;

自動化樣本處理、建庫及分析流程,保障高效周期,40天極速交付;

低至10ng建庫,滿足穿刺、流式分選、微切等微量珍貴樣本的研究;

重點團隊在Nature、Epigenetics、DNA Res等雜志發表多篇SCI論文;

專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。

科學方案設計

從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型

樣本要求

基因組DNA

總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量

細胞、全血、動物新鮮冷凍組織

按照送樣要求準備

備注1:不推薦FFPE、cfDNA等片段化樣本類型;

備注2:不適合植物物種;

備注2用封口膜密封樣品; 干冰運輸

數據分析

RRBS

分析內容

備注

標準分析

1、測序數據質量評估

過濾掉低質量數據,保證數據質量

2、與參考基因組比對

比對率和覆蓋度分析

3、MSPI酶切及Bisulfite轉化率質控

MSPI酶切效率>95%; Bisulfite轉化率>99%

4、甲基化位點Calling

評估胞嘧啶甲基化狀態

5、甲基化分布圖譜分析

甲基化在基因組、功能元件上的分布

6、組間差異甲基化DMR分析

尋找DMR及注釋

7、差異甲基化基因DMG分析

DMG富集分析GO,KEGG

8、多樣本聚類分析

PCA分析多樣本甲基化變化規律

高級分析

9、多組學整合關聯分析

例如與轉錄組關聯分析

10、其它定制化分析

結合課題背景亮點挖掘


簡化基因組甲基化測序 (RRBS)
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簡化基因組甲基化測序 (RRBS)通過酶切富集啟動子及CpG 島區域,并進行Bisulfite 測序
0755-28507994
產品介紹

簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),

通過酶切富集啟動子及CpG 島區域,并進行Bisulfite 測序;

作為高性價比的甲基化研究方法,RRBS在大規模臨床樣本的研究中具有普遍的應用;

在經典RRBS基礎上,艾斯基因在國內較早推出強化版 RRBS,助力全基因組甲基化測序,

可覆蓋全基因組范圍內超過6-9M個CpG 位點,>90%數量的CpG島及>85%數量的基因啟動子。

重點技術質控,用心服務每一個項目

艾斯團隊專注表觀組學10年,提供專業有價值的DNA甲基化完整解決方案;

較早開發RRBS技術團隊之一, 國內較早推出強化版RRBS服務;

已經完成人、哺乳動物及魚類等多個物種, 10000+例樣本項目經驗;

嚴格的RRBS技術質控,MSPI酶切率>95%, Bisulfite轉化率>99%;

自動化樣本處理、建庫及分析流程,保障高效周期,40天極速交付;

低至10ng建庫,滿足穿刺、流式分選、微切等微量珍貴樣本的研究;

重點團隊在Nature、Epigenetics、DNA Res等雜志發表多篇SCI論文;

專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。

科學方案設計

從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型

樣本要求

基因組DNA

總量≥ 1ug; 濃度≥ 30ng/ul; 完整性好; 基于Qubit定量

細胞、全血、動物新鮮冷凍組織

按照送樣要求準備

備注1:不推薦FFPE、cfDNA等片段化樣本類型;

備注2:不適合植物物種;

備注2用封口膜密封樣品; 干冰運輸

數據分析

RRBS

分析內容

備注

標準分析

1、測序數據質量評估

過濾掉低質量數據,保證數據質量

2、與參考基因組比對

比對率和覆蓋度分析

3、MSPI酶切及Bisulfite轉化率質控

MSPI酶切效率>95%; Bisulfite轉化率>99%

4、甲基化位點Calling

評估胞嘧啶甲基化狀態

5、甲基化分布圖譜分析

甲基化在基因組、功能元件上的分布

6、組間差異甲基化DMR分析

尋找DMR及注釋

7、差異甲基化基因DMG分析

DMG富集分析GO,KEGG

8、多樣本聚類分析

PCA分析多樣本甲基化變化規律

高級分析

9、多組學整合關聯分析

例如與轉錄組關聯分析

10、其它定制化分析

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